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Les virus
On a d'abord désigné sous le terme de virus tous les agents infectieux, susceptibles de provoquer l'apparition d'un ensemble morbide quand ils sont introduits dans l'organisme vivant. Le terme s'est ensuite appliqué à tout micro-organisme infectieux (y compris, par exemple, les bactéries). 
Si la notion de la contagion des maladies a été entrevue de tout temps, la cause même est restée longtemps ignorée. Dans le Dictionnaire de Littré et Robin, au mot Virus, on trouve la définition ou plutôt la déclaration suivante : 
« De même qu'il n'y a pas de chaleur séparable des corps, mais des variations de température, des états chauds et froids de la matière relativement, de même, il n'y a pas de virus en tant qu'espèce de corps ou principes pondérables ou isolables. Les virus, pas plus que les miasmes, ne sont non plus des éléments figurés, comme le supposent encore quelques médecins ou micrographes; ce sont des états virulents (totius substantiae) des corps organisés » (Dict. Littré et Robin, édit. 1878). 
Grâce aux travaux de Pasteur, ce sont les opinions des « quelques médecins et micrographes » méprisés par Robin, qui ont triomphé par la suite. On a donné le nom de virus aux agents infectieux non bactériens et non parasitaires; puis on a encore distingué les virus de deux autres agents infectieux, les viroïdes (ARN non-codant) et les prions (protéines).
Aujourd'hui on n'appelle virus que certains de ces microrganismes, dont la place dans le monde vivant est très singulière. Bien plus petits et génétiquement plus simples (un seul type d'acide nucléique) que les bactéries, ils n'ont pas de vie indépendante de celles des organismes qu'ils parasitent. 
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Virus à ADN ds Herpesvirus - Herpès, zona, varicelle, virus d'Epstein-Barr..
Simplexvirus (Virus de l'herpès humain 1, 2)
Varicellovirus  (Virus de l'herpès 3 ou de la varicelle)
Lymphocryptovirus  (Virus de l'herpès 4)
Cytomegalovirus  (Virus de l'herpès 5)
Roseolovirus  (Virus de l'herpès 6, 7)
Rhadinovirus

Poxviridés - Variole, vaccine.
Orthopoxvirus (Virus de la variole).
Capripoxvirus, Molluscivirus.

Adénoviridés
Mastadenovirus

Asfarviridés
Asfivirus

Iridoviridés
Ranavirus

Papillomaviridés
Papillomavirus

Polyomaviridés
Polyomavirus

ss Parvoviridés - Verrues, polyome, papillome..
Dependovirus, Parvovirus, Erythrovirus.

Geminiviridés
Mastrevirus, Begomovirus.

Virus à ARN ss (-)
Bunyaviridales

Bunyaviridés
Nairovirus : Virus de la fièvre hémorragique du Congo.

Orthobunyavirus : Virus de l'encéphalite de Californie

Tospovirus
Virus des Tomates.

Phlebovirus : Virus de la fièvre de la Vallée du Rift, Virus de la fièvre de Naples

Hantavirus : Virus des Andes, Virus des Bayous, Virus de New York, Virus d'Oran

Tenuivirus - Maladies du riz et du maïs.

Arenaviridés
Virus de Guanarito, Virus de Lhassa


Mononegavirales

Rhabdoviridés
Cytorhabdovirus, Nucléorhabdovirus, Vesiculovirus.
Lyssavirus (virus de la rage).

Paramyxoviridés - Oreillons, rougeole..
Henipahvirus, Rubulavirus, Avulavirus, Respirovirus, Morbillivirus, Métapneumovirus, Pneumovirus.

Orthomyxoviridés
Virus de la grippe : grippe aviaire (H5N1),  grippe espagnole et grippe A  (H1N1).

Bornaviridés
Bornavirus

Filoviridés
Marburgvirus : Virus du Lac Victoria.

Ebolavirus (virus Ebola) : E. du Zaïre, E. du Soudan, E. de Côte d'Ivoire, etc.; grave épidémie en 2014 au Libéria, en Guinée et au Sierra Leone (plus de 10 000 morts).

ss (+) Flaviviridés
Flavivirus (virus de la Dengue, virus de la fièvre jaune, virus de la fièvre de Zika, dont une épidémie s'est déclenchée depuis la fin 2015 en Amérique du Sud et dans les Antilles), Hepacivirus (virus des hépatites C et G), Pestivirus.

Picornaviridés
Hépatovirus (virus de l'hépatite A), Entérovirus (polio), Aphtovirus, Rhinovirus.

Coronaviridés
Coronavirus (virus du SRAS).

Flexiviridés
Potexvirus (virus X de la pomme de terre).

Potyviridés - maladies des plantes / mosaïque.
Potyvirus, Bymovirus.

Furoviridés -maladies des plantes / mosaïque.
Furovirus, Hordeivirus

Caliciviridés
Sapovirus, Lagovirus, Norovirus.

Togaviridés - Fièvre jaune, encéphalites, chikungunya, rubéole.
Alphavirus (virus du chikungunya, Ross River, mayaro, O'Nyong-Nyong, etc.), Rubivirus.

Astroviridés
Astrovirus

Lutéoviridés
Luteovirus

Sobemovirus

ds Réoviridés
Orbivirus, Fijivirus, Rotavirus, Oryzavirus, Coltivirus, Seadornavirus, Phytoreovirus
Rétrovirus Rétroviridés - Sida.
Deltaretrovirus, Lentivirus (HIV 1, 2)

Caulimoviridés
Badnavirus (infecte le cacao).
Tungrovirus (infecte le riz).

Hepadnaviridés
Orthohepadnavirus (Virus de l'hépatite B).

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Dictionnaire Les mots du vivant
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