Il remplit souvent plusieurs fonctions, y compris la photosynthèse, la reproduction et l'ancrage de l'organisme à son substrat. Chez les algues, le thalle peut être composé de cellules qui réalisent la photosynthèse et absorbent les nutriments directement à partir de l'eau environnante. Chez les champignons, le thalle est le corps principal de l'organisme et peut être mycélium(filaments) ou forme de champignon. On appelle aussi thalle chez les lichens l'organe qui porte la fructification, et qui n'est autre chose que le corps même du lichen.