• La recombinaison homologue. - Ce type de recombinaison se produit pendant la méiose, un processus de division cellulaire spécialisé qui conduit à la formation de gamètes (ovules et spermatozoïdes) chez les organismes sexués. Pendant la méiose, des segments homologues de chromosomes parentaux s'associent et échangent des fragments d'ADN par un processus appelé crossing-over. Cela entraîne la réorganisation des allèles sur les chromosomes, créant de nouvelles combinaisons d'allèles dans les gamètes produits.

• La recombinaison non homologue. -  Ce type de recombinaison implique des échanges d'ADN entre des régions non homologues des chromosomes. Contrairement à la recombinaison homologue qui se produit naturellement pendant la méiose, la recombinaison non homologue peut être induite expérimentalement en laboratoire. Elle est souvent utilisée dans la génétique moléculaire pour modifier des séquences d'ADN de manière ciblée, par exemple pour insérer ou éliminer des gènes spécifiques.